Primarni cilj ovog istraživanja bio je ocijeniti učinke zakonskih promjena za ustanove i društva prema članku 11. važećeg Zakona o porezu na dodanu vrijednost - banke, štedionice, štedno-kreditne organizacije, društva osiguranja i reosiguranja, privatne liječničke prakse, zdravstvene i obrazovne ustanove te druge ustanove navedene u istom članku Zakona oslobođene obveze obračunavanja PDV-a kod obavljanja svih vrsta isporuka dobara ili usluga (institucionalni pristup). Spomenuti pravni subjekti prema važećim odredbama Zakona nemaju pravo na odbitak pretporeza. Usklađivanje propisa s pravnom stečevinom EU-a donosi promjenu u smislu da će ustanove i društva iz članka 11. sadašnjeg Zakona biti obuhvaćene u sustavu PDV-a prema tzv. funkcionalnom načelu. To znači da će navedeni pravni subjekti i dalje biti oslobođeni obveze obračunavanja PDV-a bez prava na odbitak pretporeza, ali samo za određene vrste usluga i isporuka dobara definiranih u Šestoj direktivi EU-a. Također, prema istoj Direktivi, za ostale isporuke dobara i usluga imat će obvezu plaćanja PDV-a, ali i djelomičnu mogućnost povrata pretporeza. Pojednostavljeno, prema Šestoj direktivi EU-a od obveze obračunavanja PDV-a bit će izuzete pojedine vrste usluga i isporuka dobara (funkcionalni pristup), neovisno o tome koja ih ustanova ili društvo obavlja. Procjenjuje se iznos PDV-a kojeg bi ovi pravni subjekti bili dužni platiti prema propisima EU-a (obveza PDV-a za uplatu), tj. iznos proračunskih prihoda od PDV-a od ovih vrsta ustanova i društava.